電子証明書は、発行時のWindowsユーザー名とパスワードが紐付けられてます。
電子証明書発行後にWindowsユーザー名やパスワードを変更されると、発行した電子証明書はご利用頂けなくなります。

Windowsユーザー名やパスワードを変更する場合は、恐れ入りますが、事前に電子証明書の失効操作をした後に、再発行の操作を行って下さい。