可能です。
債権を譲渡する場合、全額譲渡と債権を分割して行う一部譲渡が可能です。

[譲渡記録請求仮登録]画面内、「■譲渡記録情報」欄の「譲渡種別」項目で、「一部譲渡」を選択することで分割することができます。