ID・パスワード方式の場合は問題ありません。
電子証明書方式の場合は、電子証明書発行後に設定変更されると、 発行した電子証明書はご利用頂けなくなります。
（発行した電子証明書にWindowsユーザーとパスワードが紐付けられている為）